1、看活性 益生菌必須是“活的”，才能起到健康作用，這是益生菌產生功效的基礎。益生菌是有生命活力的微生物，從生產、再在貨架待售、食用后通過胃酸、膽汁等極端環境到達腸道——這層層考驗均會消耗益生菌的活性，只有通過這些關卡并最終在腸道定點繁殖存活的益生菌才能真正發揮作用。
2、看數量 益生菌的需要量與腸道正常菌群缺失的程度和有害菌的存在數量有關。每天19-20億益生菌被認為是維持腸道正常菌群的最低限。而寶寶的益生菌需求量和大人不同，專家推薦每天攝入活菌數約40億-100億。因此，選擇高濃度活菌產品以保證益生菌在腸道維持足夠數量也是其發揮作用的前提。
3、看菌種 關于適合嬰幼兒食用的菌種，國家衛計委在2011年已經公布了菌種的名單，于2016年6月8日進行了補充修改。可作為參考，具體如下：嗜酸桿菌*(NCFM)，動物雙歧桿菌(Bb-12)，乳酸歧桿菌(HN019,Bi-07)，鼠李糖乳桿菌LGG，HN001，發酵乳桿菌(CECT5716)，短雙歧桿菌(M-16V)。
4、選劑型 酸奶中益生菌的活菌數量少，活性也差，沒有抵抗胃酸、膽汁及消化酶的能力，要順利活著到達大腸，非常不容易。而且酸奶和乳酸飲料中加入了大量的糖和甜味劑，甚至增稠劑、色素、香精等成分，這些成分也不利健康。對于較小的寶寶來說，沖劑是更好的選擇，對于較大的兒童，咀嚼片是較好的選擇。
5、臨床驗證 產品標簽中要標出菌種菌株名，要有編號，也就是說買到的益生菌一定要“有名字”，如，鼠李糖乳桿菌LGG、雙歧桿菌Bb-12等，雙歧桿菌為菌種名，Bb-12為菌株名，只有菌種名沒有菌株名字的一律不予考慮。
6、選大牌 選購益生菌要選擇可靠的大品牌，安全、衛生、可靠。具備保健食品標志（藍帽子）的品質更有保障。有些益生菌的品牌雖然不是知名品牌，但為大企業供應菌粉，或指定給運動員、航天員等使用，且用戶口碑不錯的，都可考慮信任。
益生菌可以起到緩解兒童腹瀉，濕疹等癥狀；但畢竟是輔助用品，關鍵是提高兒童自身的免疫力；同時，不能要求說吃了保健類益生菌可以馬上起效，畢竟這不是藥品，起效會相對慢一點，有專家建議服用至少2-3個月才會見到效果。
