專業和科室設置不同

眼科專科醫院一般專攻眼科這一科室，在眼科專業方面的的經驗比起綜合醫院來說可能更加豐富。而綜合醫院的科室設置齊全，內科、外科、婦產科、兒科、五官科等所有科室無所不包，技術水平較為均衡。

設備和手術量不同

比起綜合醫院來說，眼科專科醫院的設備會更加齊全，手術量也會更多一點，因為眼科醫院只進行眼部疾病方面的治療，從眼科疾病方面來說，它的經驗要比綜合醫院更豐富。但是具體的還是要看眼科醫院的水平，如果只是一家小眼科診所的話，那可能和綜合醫院相比沒有什么特別大的優勢。