1、純度不同

醫用酒精的純度有多種，常見的為75醫用酒精和95醫用酒精。食用酒精的度數也有很多種，根據不同的純度可以分為高度酒和低度酒等。但兩者的純度區分方式是不同的。

2、來源不同

食用酒精的主要來源是糧食或農作物，以谷物、薯類等農作物為主要發酵原料，而醫用酒精主要的成分是乙醇。

3、用途不同

醫用酒精的用途有很多，不同濃度的醫用酒精的用途也各不相同，75醫用酒精主要用作消毒殺菌、30醫用酒精主要用于發燒降溫，此外還有其他濃度的醫用酒精，也都有各自的用途。食用酒精主要就是用來喝，也能應用于食品工業。